Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf18Q7TS55 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms