Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpf1Q7TND5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpf1Q7TND5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms