Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN73

Casd1, N-acetylneuraminate 9-O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casd1Q7TN73 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Casd1Q7TN73 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casd1Q7TN73 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casd1Q7TN73 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casd1Q7TN73 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casd1Q7TN73 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casd1Q7TN73 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casd1Q7TN73 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casd1Q7TN73 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casd1Q7TN73 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casd1Q7TN73 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casd1Q7TN73 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Casd1Q7TN73 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casd1Q7TN73 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casd1Q7TN73 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casd1Q7TN73 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms