Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shq1Q7TMX5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Shq1Q7TMX5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Shq1Q7TMX5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shq1Q7TMX5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
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