Protein–RNA interactions for Protein: Q7M757

C6.1al, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36-like, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6.1alQ7M757 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C6.1alQ7M757 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C6.1alQ7M757 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C6.1alQ7M757 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C6.1alQ7M757 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C6.1alQ7M757 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C6.1alQ7M757 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C6.1alQ7M757 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C6.1alQ7M757 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C6.1alQ7M757 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C6.1alQ7M757 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6.1alQ7M757 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6.1alQ7M757 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 227.8 ms