Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GypcQ78HU7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GypcQ78HU7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GypcQ78HU7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms