Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ssh1Q76I79 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssh1Q76I79 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssh1Q76I79 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms