Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1cQ76I25 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms