Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ube2d2bQ6ZWY6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.6 ms