Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spcs3Q6ZWQ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spcs3Q6ZWQ7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spcs3Q6ZWQ7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spcs3Q6ZWQ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spcs3Q6ZWQ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spcs3Q6ZWQ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spcs3Q6ZWQ7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spcs3Q6ZWQ7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spcs3Q6ZWQ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spcs3Q6ZWQ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spcs3Q6ZWQ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spcs3Q6ZWQ7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms