Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nup188Q6ZQH8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nup188Q6ZQH8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nup188Q6ZQH8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup188Q6ZQH8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms