Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scgb2b2Q6UGQ3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scgb2b2Q6UGQ3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scgb2b2Q6UGQ3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scgb2b2Q6UGQ3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scgb2b2Q6UGQ3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scgb2b2Q6UGQ3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms