Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5P0

Tlr11, Toll-like receptor 11, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr11Q6R5P0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr11Q6R5P0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tlr11Q6R5P0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr11Q6R5P0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms