Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna2d2Q6PHS9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d2Q6PHS9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna2d2Q6PHS9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms