Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3c3Q6PF93 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3c3Q6PF93 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pik3c3Q6PF93 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms