Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SvoplQ6PDF3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SvoplQ6PDF3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms