Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sik3Q6P4S6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sik3Q6P4S6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sik3Q6P4S6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sik3Q6P4S6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sik3Q6P4S6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sik3Q6P4S6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sik3Q6P4S6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sik3Q6P4S6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sik3Q6P4S6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sik3Q6P4S6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sik3Q6P4S6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sik3Q6P4S6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sik3Q6P4S6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sik3Q6P4S6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Sik3Q6P4S6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sik3Q6P4S6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms