Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac10Q6P3E7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac10Q6P3E7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac10Q6P3E7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms