Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp4r3aQ6P2K6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp4r3aQ6P2K6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4r3aQ6P2K6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4r3aQ6P2K6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp4r3aQ6P2K6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp4r3aQ6P2K6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms