Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl3Q6P1Y1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl3Q6P1Y1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms