Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga3Q6NZL0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Soga3Q6NZL0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Soga3Q6NZL0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms