Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpdc1Q6NZK8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptpdc1Q6NZK8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpdc1Q6NZK8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms