Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad17Q6NXW6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rad17Q6NXW6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rad17Q6NXW6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad17Q6NXW6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms