Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3bQ6NWW9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms