Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bfsp2Q6NVD9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bfsp2Q6NVD9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms