Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mvb12bQ6KAU4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mvb12bQ6KAU4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mvb12bQ6KAU4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms