Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ParpbpQ6IRT3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ParpbpQ6IRT3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ParpbpQ6IRT3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms