Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qtnf6Q6IR41 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1qtnf6Q6IR41 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1qtnf6Q6IR41 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms