Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt39Q6IFX4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt39Q6IFX4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt39Q6IFX4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms