Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Best3Q6H1V1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Best3Q6H1V1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms