Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nckap5lQ6GQX2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nckap5lQ6GQX2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nckap5lQ6GQX2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms