Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms