Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep290Q6A078 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms