Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc5lQ6A068 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc5lQ6A068 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdc5lQ6A068 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms