Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Swap70Q6A028 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Swap70Q6A028 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms