Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PnkdQ69ZP3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PnkdQ69ZP3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms