Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn4Q69Z26 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cntn4Q69Z26 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms