Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kiaa1549Q68FD9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Kiaa1549Q68FD9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kiaa1549Q68FD9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms