Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sbno1Q689Z5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sbno1Q689Z5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Sbno1Q689Z5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sbno1Q689Z5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms