Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nlrp9bQ66X22 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlrp9bQ66X22 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms