Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CilpQ66K08 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CilpQ66K08 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CilpQ66K08 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CilpQ66K08 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CilpQ66K08 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CilpQ66K08 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CilpQ66K08 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CilpQ66K08 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CilpQ66K08 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CilpQ66K08 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CilpQ66K08 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CilpQ66K08 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CilpQ66K08 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CilpQ66K08 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CilpQ66K08 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CilpQ66K08 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CilpQ66K08 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CilpQ66K08 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CilpQ66K08 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CilpQ66K08 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CilpQ66K08 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CilpQ66K08 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CilpQ66K08 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CilpQ66K08 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CilpQ66K08 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CilpQ66K08 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CilpQ66K08 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CilpQ66K08 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CilpQ66K08 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CilpQ66K08 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CilpQ66K08 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CilpQ66K08 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CilpQ66K08 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CilpQ66K08 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CilpQ66K08 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CilpQ66K08 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CilpQ66K08 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CilpQ66K08 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CilpQ66K08 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CilpQ66K08 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CilpQ66K08 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CilpQ66K08 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CilpQ66K08 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CilpQ66K08 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CilpQ66K08 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CilpQ66K08 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CilpQ66K08 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CilpQ66K08 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CilpQ66K08 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CilpQ66K08 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CilpQ66K08 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CilpQ66K08 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CilpQ66K08 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CilpQ66K08 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CilpQ66K08 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CilpQ66K08 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CilpQ66K08 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms