Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp9Q64HY3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sp9Q64HY3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms