Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
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Clcn1Q64347 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
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Clcn1Q64347 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
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Clcn1Q64347 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
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Clcn1Q64347 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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Clcn1Q64347 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
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Clcn1Q64347 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
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Clcn1Q64347 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
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Clcn1Q64347 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
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Clcn1Q64347 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
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