Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2e1Q64104 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2e1Q64104 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2e1Q64104 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2e1Q64104 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2e1Q64104 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2e1Q64104 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2e1Q64104 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2e1Q64104 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2e1Q64104 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2e1Q64104 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2e1Q64104 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2e1Q64104 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms