Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Ccdc18Q640L5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ccdc18Q640L5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ccdc18Q640L5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.3
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