Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PatjQ63ZW7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PatjQ63ZW7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PatjQ63ZW7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms