Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zic2Q62520 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic2Q62520 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms