Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp4Q62445 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sp4Q62445 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp4Q62445 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms