Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl12Q62401 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms