Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf6Q62311 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf6Q62311 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms